BCH210 Biochemistry(生物化学)代写

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BCH210 Itchy and Scratchy Assignment代写

Assignment Instructions for the “Biochem Fall 202x – Itchy and Scratchy Assignment”

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“生物化学秋季 20xx – Itchy and Scratchy 任务”

一般要求
目标: 探索组胺在体内的作用，并了解为什么饮酒后蚊子叮咬更痒。
目的: 通过研究课题，使用计算工具分析蛋白质结构与功能，并有效地传达科学理解。
学习成果:
o 描述细胞中生物分子的结构与相互作用。
o 解释蛋白质的作用以及细胞环境对其功能的影响。
o 对比用于纯化和研究蛋白质的实验方法。
o 查找并总结相关的同行评审文献。
o 使用在线科学资源展示对蛋白质结构/功能的理解。
o 以书面形式有效传达科学概念。

格式和提交指南
长度:
o 每个部分最大1页（约500字）。
o 图表、图表标题和参考文献列表不包括在字数内。
格式:
o 12号字体，单倍行距。
o 页边距不小于1.5厘米。
o 不要包括封面页。
图表:
o 将相关图表放在相应文本附近。
o 在文本中引用所有图表。
o 图表标题放在图表下方；表格标题放在表格上方。
参考文献:
o 使用CSE引用格式（作者 年份）。
o 在末尾包括参考文献列表（不计入字数）。
学术诚信:
o 对非原创思想进行改写并正确引用来源。
o 不要使用生成式AI工具，如ChatGPT。
o 作业将进行抄袭检查。

任务部分和要求

1. 引言（最大1页）
   组胺概述:
   o 解释为什么在蚊子叮咬后会产生组胺。
   o 描述组胺在体内的作用，包括其产生和存在的位置。
   组胺作为氨基酸衍生物:
   o 讨论为什么组胺被视为氨基酸衍生物。
   o 提供组胺的化学结构。
   基于功能团的性质:
   o 描述组胺基于其功能团的性质。
   o 使用MetaCyc等资源探讨组胺合成并确认其氨基酸前体。
   背景相关性:
   o 提供任务的背景和相关性。
   o 将你的观点有条理地链接到任务的其余部分。
   o 强调为什么生物化学对于理解组胺至关重要。
   风格建议:
   确保清晰和语法正确。
   将内容组织成有条理的段落。
2. 组胺代谢（最大1页）
   酶促生产与代谢:
   o 研究并描述组胺在人类体内的酶促合成和分解过程。
   创建图表:
   o 说明组胺的合成和降解途径。
   o 包括底物和产物的名称与结构。
   o 显示涉及的酶和任何辅因子。
   描述酶机制:
   o 对三种主要酶进行说明：
    提供它们的分类（酶类别和子类）。
    解释它们如何在分子水平上催化反应。
    讨论任何必需的辅因子（如结构性、催化性）。
   使用BRENDA数据库:
   o 从BRENDA酶数据库收集酶的信息。
   注意:
   将草稿中的任何表格替换为详细的书面描述。
   提供具体细节以展示对酶机制的深入理解。
3. 蛋白质结构（最大1页）
   选择一个蛋白质:
   o 选择一个蛋白质结构：PDB ID 1JQD 或 PDB ID 3HI7。
   可视化蛋白质:
   o 使用RCSB PDB网站查看蛋白质结构。
   o 将蛋白质定向，显示为完整的卡通链彩格式。
   o 导出蛋白质的图像。
   标记关键特征:
   o 指示N-末端和C-末端。
   o 高亮显示任何生理相关的分子或结合位点。
   描述蛋白质结构:
   o 一级结构:
    讨论氨基酸序列。
    注意任何缺失的残基。
   o 二级结构:
    识别存在的二级结构类型（α-螺旋，β-折叠）。
    指定它们的位置。
   o 三级结构:
    描述任何结构动机或结构域。
    解释它们如何有助于蛋白质的功能。
   o 四级结构（如适用）:
    讨论亚单位间的相互作用。
   引用具体示例:
   o 提到具体的氨基酸及其残基编号。
   o 讨论对结合相互作用重要的功能团。
   包括放大图像:
   o 重点展示介导结合相互作用的重要区域。
   o 显示侧链和附近参与的氨基酸。
   o 检查非共价相互作用（例如，氢键、离子相互作用）。
   图表:
   每个图表下面都包括标题。
   在文本中引用图表以支持解释。
4. 蛋白质纯化和表征（最大1页）
   总结纯化协议:
   o 创建图表或流程图，概述用于获得蛋白质结构的方法。
    包括表达系统、蛋白质构建的细节、裂解程序、色谱技术和结构确定方法。
   提供理由（半页段落）:
   o 解释为什么采取每个步骤。
   o 讨论获得纯净蛋白所需的生化条件和实验。
   o 将方法与以下相关概念联系起来：
   细胞裂解方法、色谱技术（如尺寸排阻色谱SEC、离子交换色谱、亲和色谱、透析、高效液相色谱HPLC）、SDS-PAGE纯度评估、蛋白质鉴定方法（SDS-PAGE、免疫印迹Western Blot、质谱MS、Edman降解、酶学和化学切割）、蛋白质表征方法（紫外可见光谱、红外光谱、圆二色光谱、核磁共振NMR光谱、荧光光谱）、结构确定技术（X射线晶体学、冷冻电子显微镜Cryo-EM、AlphaFold和计算预测）、荧光显微镜、融合蛋白和标签、蛋白质-蛋白质相互作用研究（拉下实验、共免疫沉淀Co-IP、交联试剂、生物标记法Proximity-Dependent Biotinylation）、监测酶催化反应、pH和酶的实际应用。
   阅读相关期刊文章:
   o 在实验程序部分查找详细方法。
   o 用文章中的信息补充你的总结。
   图表格式:
   图表及其标题必须适合一页。
   将图表标题放在图表下方。
5. 饮酒的影响（最大1页）
   回答核心问题:
   o “为什么饮酒后蚊子叮咬更痒？”
   假设形成:
   o 根据你的理解和研究。
   进行额外研究:
   o 收集支持你的假设的证据。
   解释分子机制:
   o 讨论引起痒感增加的生物化学基础。
   o 解释酒精及其代谢物对以下方面的影响：
    组胺水平。
    酶活性。
    受体相互作用。
   整合课程概念:
   o 强调结合相互作用的重要性。
   o 描述分子如何与特定蛋白质和酶相互作用。
   o 讨论对调节和功能的影响。
   总结与结论:
   o 总结你的发现及其重要性。
   o 提供简短的结论（2-3句话），反映生物化学在理解身体过程中的重要性。
   风格建议:
   确保论证逻辑清晰，基于证据。
   使用清晰简明的语言。

风格和展示
清晰与组织:
o 逻辑和有条理地展示观点。
o 使用适当的语法和句子结构。
证据支持的陈述:
o 用可靠来源的证据支持所有主张。
o 正确引用所有参考文献。

提交详情
截止日期:
o 在20xx年xx月xx日，星期二，东部时间下午5点之前提交作业。
o 至少提前30分钟提交，以避免技术问题。
迟交:
o 罚分: -10%
o 截止日期后一周内不接受任何提交。

最终检查单
内容:
o 你是否彻底完成了所有部分？
格式:
o 文档是否符合所有格式要求？
o 图表和表格是否正确标注并引用？
参考文献:
o 是否正确引用了所有来源？
o 参考文献列表是否完整且格式正确？
学术诚信:
o 是否正确改写并引用了所有非原创思想？
o 是否避免使用禁止的AI工具？
校对:
o 是否检查了拼写和语法错误？
o 语言是否清晰和专业？

评分标准与分数分配:

1. 引言（4分）
   要求:
   o 提供关于组胺、其在体内的作用和来源的清晰简明的背景信息。
   o 包括组胺的分子结构。
   o 描述功能团和在蛋白质结合中的非共价相互作用类型。
   o 解释生物化学如何有助于理解分子结合和组胺的作用。
   评分:
   o 完成得很好（4分）：详细写作和深思熟虑的分析。
   o 很好（3.5分）：少量细节缺失。
   o 良好（3分）：理解良好；需要额外的组织或分析。
   o 尚可（2.5分）：需要更深入的理解和分析。
   o 足够（2分）：最基本的信息；需要更多细节和澄清。
   o 满意（1.5分）：需要重大改进；请寻求帮助。
   o 需要显著改进（1分）：缺失重要元素；未达到要求。
   o 无分（0分）
2. 组胺代谢（4分）
   要求:
   o 描述组胺的生产和代谢过程。
   o 包括酶催化反应，底物和产物的结构。
   o 提供生理和细胞位置。
   o 详细说明三种主要酶的分类、机制和辅因子。
   评分:
   o 完成得很好（4分）：对组胺代谢中酶的解释详尽。
   o 很好（3.5分）：少量细节缺失。
   o 良好（3分）：理解良好；需要更多的细节。
   o 尚可（2.5分）：需要更深入的理解。
   o 足够（2分）：最基本的信息；需要更多细节。
   o 满意（1.5分）：需要显著改进；请寻求帮助。
   o 需要显著改进（1分）：缺失重要元素；未达到要求。
   o 无分（0分）
3. 蛋白质结构（4分）
   要求:
   o 提供蛋白质结构的详细描述，并附上来自RCSB网站的图表。
   o 讨论蛋白质的整体结构和可见的结构层次。
   o 提供非共价相互作用的具体示例。
   评分:
   o 完成得很好（4分）：详尽的写作和深思熟虑的分析。
   o 很好（3.5分）：少量细节缺失。
   o 良好（3分）：理解良好；需要更多细节或分析。
   o 尚可（2.5分）：需要更深入的蛋白质结构理解和分析。
   o 足够（2分）：最基本的信息；需要更多的结构细节。
   o 满意（1.5分）：需要显著改进；请寻求帮助。
   o 需要显著改进（1分）：缺失重要元素；未达到要求。
   o 无分（0分）
4. 蛋白质纯化和表征（4分）
   要求:
   o 提供蛋白质纯化协议的书面描述，并附上流程图。
   o 详细说明用于获得纯蛋白的生化技术。
   o 解释如何识别蛋白质及其结构的实验确定。
   评分:
   o 完成得很好（4分）：详尽的写作和深思熟虑的分析。
   o 很好（3.5分）：少量细节缺失。
   o 良好（3分）：提供了基本实验；需要更多的细节和理由。
   o 尚可（2.5分）：需要更深入的纯化协议理解。
   o 足够（2分）：最基本的信息；需要更多细节。
   o 满意（1.5分）：需要显著改进；请寻求帮助。
   o 需要显著改进（1分）：缺失重要元素；未达到要求。
   o 无分（0分）
5. 饮酒的影响（4分）
   要求:
   o 提供为什么饮酒后蚊子叮咬更痒的生物化学基础。
   o 讨论受酒精代谢物调节的蛋白质和酶的作用。
   o 总结从整个任务中的学习并给出结论。
   评分:
   o 完成得很好（4分）：详尽的写作和深思熟虑的分析。
   o 很好（3.5分）：少量细节缺失。
   o 良好（3分）：理解良好；需要更多的组织或分析。
   o 尚可（2.5分）：需要更深入的理解和分析。
   o 足够（2分）：最基本的信息；需要更多细节。
   o 满意（1.5分）：需要显著改进；请寻求帮助。
   o 需要显著改进（1分）：缺失重要元素；未达到要求。
   o 无分（0分）
6. 风格（4分）
   要求:
   o 清晰有效地书写，易于理解。
   o 确保观点传达清楚。
   o 消除拼写和语法错误。
   o 始终使用标准CSE文献格式。
   评分:
   o 完成得很好（4分）：非常出色；无需修改。
   o 很好（3.5分）：少量错误。
   o 良好（3分）：需要进行一些编辑或格式调整。
   o 尚可（2.5分）：需要更多编辑。
   o 足够（2分）：观点需要更清晰的传达；需要编辑。
   o 满意（1.5分）：需要显著改进；请寻求写作帮助。
   o 需要显著改进（1分）：书写困难，需大幅编辑。
   o 无分（0分）